Options Indexesを使う
コアモジュールが何でそうでないモジュールが何なのかをきちんと理解できていれば難しくはない。本家サイトに全て書いてます。
以下の設定ではhogemogeディレクトリ以下だけでツリー構造で見える。ドキュメントルート以下は-Indexesでツリー構造はoff、hogemogeだけon。
ServerRoot "/etc/httpd"
Listen 80
LoadModule mime_module modules/mod_mime.so
LoadModule autoindex_module modules/mod_autoindex.so
User apache
Group apache
DocumentRoot "/var/www/html"
TypesConfig /etc/mime.types
Options +Indexes
Options -Indexes